PrismのWPFとXamarin.Forms（こっちはまだPreview）には、プロジェクトテンプレートが提供されています。 拡張機能でPrismで検索すると、Prism Template Packというものがヒットします。
こいつをインストールすると、Prism.Unityを使ったプロジェクトテンプレートと、モジュールのプロジェクトテンプレートが追加されます。
こいつを新規作成すると以下のような感じのファイルが作られます。
PrismでWPFアプリ作るのにめんどくさいとっかかりが楽になるので大分助かりますね。